癌症生存率预测新方法
合肥11月14日电 14日,癌症记者从中国科学技术大学获悉,生存该学校的率预苏州高等研究院和生物医学工程学院,由周少华教授领衔的测新团队提出了一种更加精确且可解释的多模态癌症生存分析新方法,使得癌症生存预测更加精准。癌症
据介绍,生存这一突破性进展缩小了病理图像和基因表达数据之间的率预“语义鸿沟”,使癌症生存预测更精准并可解释,测新不仅能让更多癌症患者从精准治疗中获益,癌症还可以避免过度治疗,生存有助于医疗资源的率预最优配置,为精准肿瘤诊治开辟道路。测新研究成果最近发表在《IEEE模式分析与机器智能汇刊》上。癌症
癌症生存分析对于精准医疗至关重要,生存能够辅助医生定制个性化的率预治疗方法。然而,在传统的分析方式中,始终存在一个难题——“病理影像与基因表达之间的微观交互不足”。
为了解决这个问题,研究小组研发出了新型的“通路感知多模态Transformer(PAMT)框架”,通过三个步骤来实现对多种模式数据的精细互操作与融合。
第一步,首先让单模态数据内部“信息交流”,利用自注意力机制使生物通路之间和病理图像块充分传递信息;第二步,通过全新的无配对标签对比学习方法,让生物通路和病理图像块的语义信息对齐,确保它们能够“说同一种语言”;第三步,遵循“基因型决定表型”的医学先验,以生物通路为指导,实现两种数据的精准融合,真正捕捉到癌症发展的核心关联。
研究发现,PAMT不仅预测效果显著,在膀胱癌、肺鳞状细胞癌和肺腺癌三种癌症数据集上其生存预测性能均优于现有主流方法,并且具有出色的“可解释性”。PAMT可以帮助病理医生迅速筛选出影响存活的关键生物通路、在全切片病理图像中定位这些通路受影响的区域,以及挖掘与预后相关的病理图像特征。据报道,该团队已搭建了公开网站,展示了186条生物通路对全切片病理图像各个区域的影响情况。